从《血色之章》开始，柯南的主线剧情就进入了深水区。以前不小心出现的与主线剧情相关的情节，现在三言两语就抛出了伏笔。在正文之前，小编先分析一下红黑双方的实力：满月篇之前，柯南（红方）单打独斗处于劣势，但随着FBI的加入，红黑双方的实力红黑两面大致平衡。一方正在悄悄调查，另一方则与世界为敌。红与黑的纠葛一直持续到波旁的真实身份被揭露。安插了两名卧底的柯南（红方）无疑占据了优势，而在血色战团之后，二号组织朗姆酒开始行动。关于这篇文章，涉及的内容是分析目前仍然存疑的事件，对主角身份的怀疑，顺便梳理一下目前支持率较高的理论。
重要“历史事件”人鱼岛埋下伏笔
青山的采访中提到了美人鱼岛问题的根源。在《儒艮箭》中，账本上写的是“宫野志保”，柯南说：“那家伙不应该是追求永生的类型。”然后这一幕就到此结束了，青山老师明确指出这是有伏笔的。
组织不会允许重要成员雪莉单独外出，所以我们推测组织的其他成员也会陪她一起出去。宫野志保旁边的名字很可能是某个组织成员的名字。至于此行的目的，第一个可能就是执行任务。平次的书中收录了前外务大臣、内阁官房长官、日本银行行长以及许多其他过去负责领导日本政府事务的重要人物的名字。根据组织的实力，将这些人消灭得不留痕迹，也是很正常的事情。
组织制造APTX-4869药物的根本目的是为了让人们不再受到时间洪流的影响，所以更可能是在这里研究长生不死的方法来辅助配制药物。
板仓拓的伏笔
这个案例显然与组织的最终目标相关。青山采访中也有类似的暗示：板仓拓死后，柯南带着CD去找Gin。这个故事还会有更多的消息，而且肯定会有后续！
板仓拓开发的软件对组织来说很重要，可以不断骚扰。而且，该组织的明确目的让板仓拓畏“为了全人类”。该软件的内容未知，但肯定与药品有关。文章中有一个明显的暗示：“我们既可以是上帝，也可以是魔鬼。因为我们试图逆着时间的洪流使死人复活。”上帝，或者魔鬼，因为我们正试图在时间的洪流中唤醒死者）。所谓神，当然是指APTX-4869药物所立下的功绩及其奇效。魔鬼是指该组织的巨大野心及其对全人类的危害。无论如何，组织的目的不仅仅是永生那么简单。
羽田浩二事件
我们先来说说嫌疑人。根据羽田浩二的线索——失踪镜子（A、S、A、C、A、R、U、M），大致有三种理解方式。分类标准是Asaka和Rum之间的关系。首先，阿萨卡是朗姆酒。其次，罪犯是阿萨卡和朗姆酒。第三，告诉阿萨卡要警惕朗姆酒。灰原、柯南和赤井倾向于接受第一种选择。不过，羽田浩二不一定和该组织有关系，他也不一定知道朗姆酒是什么意思。他可能只是听人说话才知道凶手的名字，所以第一个假设就有点无法解释了。当有人被杀时，记录凶手的名字是合理的。第二个应该是人类的正常反应。第三种假设是基于朝霞和若狭是同一个人的理论。根据那张照片，我们知道朝香是一名女性，可能与羽田事件有关。唯一可能与羽田事件有关的女性是若狭留美。若狭在帐篷被烧毁事件中的表现表明，她和浩二的关系非常亲密，所以羽田浩二临死前提醒她要警惕朗姆酒也是合乎逻辑的。
黑田平在事件中的立场应该是旁观者，而他心目中若狭的形象也表明两人的关系已经是17年前的事情了。一种可能是黑田就是杀死羽田浩二的人，或者是若狭对黑田对死亡的漠视表示愤慨。按照若狭就是朝霞的逻辑，后者的可能性更大一些。
赤井武武也是与此案相关的人士，但在事件报道中明显看出他并不是参与谋杀案的人员之一，而且他是少数有明确立场的人物之一。也许他在追捕朗姆的过程中亲眼目睹了羽田被杀，但他随后的失踪或将妻子和孩子送往日本证明了他的身份暴露。由此诞生了“黑田是赤井说”。
主线重要人物身份存疑：乌丸莲也
自从青山确认乌丸莲野是该组织的老大之后，主要的问题就是乌丸莲野是否死了。毕竟组织的老大并不一定是柯南的老大。与乌丸相关的信息大致是这样的。四十年前，乌丸莲哉为了延续自己的生命，成立了一个组织，网罗天下精英，筹集资金，揭开暮光阁的秘密。但不久他的死期临近，他又接连杀害学者，并编造了一场拍卖惨案。
乌丸恋哉是否会死，取决于长生药有没有（第一代药名为“银弹”，是宫野夫妇制作的，“APTX-4869”是悉尼在第一代的基础上制作的第二代药——一代药）被生产出来。贝尔莫德服用灰原父母创造的“银弹”，数年不衰老（具体时间未知），因此可以推断药物的作用是生理年龄静止。 40年前，海媛的父母加入该组织并研发毒品。贝尔莫德自从20年前杀死朱迪的家人以来，他的外貌一直没有改变。这种药物很可能是二十、三十年前开发出来的，所以乌丸莲夜如果服用了这种药物，死亡的可能性很小。
朗姆酒
猩红篇之后，基尔发来短信宣布柯南将进入朗姆篇。在三名犯罪嫌疑人的案件中，小艾指出了朗姆犯罪嫌疑人的特征，随后三名具有“义眼”特征的犯罪嫌疑人相继出现，这与波旁王朝章节的开头方式非常相似。我们先来分析一下嫌疑人。
1、黑田平（白发、独眼男子，50岁，从长野县警察局调到搜查一科任科长）已在医院昏迷十年。 “他好像变了。” 。因为他第一次出现是在指出朗姆特征的三名嫌疑人案后不久，所以柯南关注的焦点是他是否真的变了一个人。首先，之前的小事他都忘记了，有被调动的可能。也许这是朗姆渗透警察系统的方式，也许它是组织的敌人。其次，他非常关心柯南。在《啄木鸟事件》中第一次见到柯南时，他是这样说的：“他每次都能从意想不到的角度发现解决事件的线索，推动推理的进展。他是沉睡中的小五郎的大脑。有传言说，这在国家警察厅，江户“柯南川”。如果黑衣组织是针对柯南的话，他们绝对不会这样警告自己的猎物，更何况，该组织没有理由将朗姆这样的关键人物派往长野，所以黑田的立场。但他可能知道警视厅已经以卧底身份渗透到该组织，或者该组织已经开始关注有关凶手的消息，另一个重要的证据就是小艾无孔不入的“黑”。至于最近与阿姆罗的对话并称他为bobon，有可能他只是阿姆罗渗透组织的同谋，或者是负责组织行动的警察的上级。他的身份无法确定。
2、若狭瑠美（田丹小学转来的副班主任，37岁）首先，在焚烧帐篷事件中，她对黑田表现出了敌意，表明两人之前有过纠葛。主线剧情已经进入了朗姆酒篇，所以两人相遇的时间大概就是十七年前的羽田浩二案中。另外，若狭先生对柯南特别关心，似乎是故意通过弄脏画作并回家拿颜料来测试柯南的能力。小艾曾经对此有过雷达反应，所以她至少曾经是该组织的一员。不过，考虑到小艾口口声声拒绝怀疑若狭，而且羽田案发生时她只有20岁，所以成为凶手的可能性很低。相反，他以朝香的身份参加，但他更有可能因为羽田芽衣的死而叛乱。那么接下来测试柯南的能力，询问小艾工藤新一的身份，都是有意义的，那就是寻找合作者，向组织复仇。不管她是不是朗姆，若狭老师的身份都很微妙。能够看到该组织的死亡名单，说明她与该组织仍然保持着持续的联系。
3. 胁田加诺（寿司店店员，森小五郎的徒弟之一）是朗姆三名嫌疑人中最有可能的。第一次出现，恰逢蒙面超人敌方老大的心腹出现。这不禁让人想起阿姆罗出现时客人点的波本威士忌。当然，也不排除是青山先生的欺骗。另一方面，修学旅行事件结束后，胁田兼野立即前去探望，这也符合组织闻讯后的正常反应。但疑点在于，该组织的二把手极不可能在寿司店工作；组织高级人员仪表仪表不合理；如果他退一步，他的眼病就会痊愈，这与朗姆智能的义眼理论不符。所以它不一定是朗姆酒。但他可能只是组织的一名基层调查员，前往森厅、工藤新一的宅邸、波洛进行监视调查。
这样看来，三名官方嫌疑人是朗姆酒就说不通了，这与“红茶论”的独特观点是一致的。大致是这样的：三杯带有骷髅标记的茶对应朗姆酒的三个图像（海盗的独眼、——朗姆酒的义眼），一杯普通的红茶对应真正的朗姆酒。最后三个骷髅印记的消失表明这三个人都不是他们本人，而朗姆在组织中的三个形象都是假的。最重要的证据就是红茶游戏恰好出现在《猩红结局》章节中。严格来说，还是主线剧情，如果是线索也很正常。而和解之后，基尔关于朗姆酒的短信立刻就发了过来，似乎是故意将红茶游戏和朗姆酒联系起来。站在整体的角度想一想，在紧凑的主线剧情中插入日常生活是再正常不过的事了。这就是红茶理论的背景。
波本和基尔
在剧场版的纯黑噩梦中，两人几乎全裸，让人开始怀疑他们在主线剧情中的暴露。第一个是波本威士忌。作为组织中非常有能力的“侦探般的人物”，他的卧底身份甚至对基尔隐瞒了。但他犯了一个大疏忽，就是谎报了赤井的死讯。如果该组织知道赤井假死的计划，要么会对波本的调查能力产生怀疑，要么就会开始将波本列入卧底名单。根据几乎结论性的詹姆斯·布莱克理论（或简称詹姆斯·布莱克理论），这确实是很有可能的。因此，在猩红之弧之后，朗姆立即的行动可能就是刺探波旁王朝。而调查工藤新一的死因或许只是一次审判。这么一想，波旁已经暴露了一半了。另一方面，基尔的卧底工作也并不成功。从基尔发信息的频率和字数来看，该组织从未放弃对她的监视。
詹姆士
业内比较接受的理论之一是詹姆斯黑理论，这意味着FBI的詹姆斯是黑人组织的卧底特工。这一理论的背景是，随着凯尔和波旁作为卧底特工的引入，局势迅速从黑方优势转变为红方明显优势。而根据青山从红黑章到猩红章所埋下的八年的伏笔，我们可以大胆推测，或许詹姆斯刚出场时就是指定的卧底人选。可以作为证据的信息如下：
首先，当詹姆斯第一次出现在熊猫案中时，海媛有轻微的反应，这可以解释为她的黑色组织雷达正在工作。于是柯南就想到了“莫里亚蒂教授”，它象征着未暴露身份、一直掌握情报的卧底特工，也是“福尔摩斯”最大的敌人。随后詹姆斯提到自己来自传奇黑帮的故乡卡彭，而卡彭的这个提法也在血腥情人节案中再次被提及，这可能是对他身份的暗示。
对詹姆斯身份的质疑在于他缺乏对抗组织的理由。水菜丽娜、朱迪·斯托林和赤井修一都有因该组织而丧生的亲戚。卡梅尔责怪自己破坏了赤井秀一的计划。就连安室彻也透露了剧中的一些回忆。只有詹姆斯没有这样的情感动机，他的背叛最终也不会让剧情变得生硬。
另一方面，在红与黑篇中，本藤荣佑在医院里听到了《七只乌鸦》，因此柯南将注意力集中在楠田六道身上。但楠田六道连酒名都没有，水平与宫野明美相当。他是组织的外围成员，不可能有资格直接接触老板。而且，既然他是金派来的，他就应该通知无水计划的负责人金，这进一步证明了“七鸦”并不是他派来的。那么，向老大汇报情报的人，很可能就是看守米无志的FBI。
最后一个问题是，为什么该组织尚未对基尔采取行动。如果凯尔被杀，就意味着消息已经曝光，那么詹姆斯作为知道水舞计划的人之一，就会第一个受到怀疑。我们可以推测，詹姆斯在组织中的地位高于贝尔莫德和金，而且他掌握了阿凯在两人不知情的情况下假死的计划。在接受青山采访时，他表示Gin在组织中的地位可以排进前十。如果詹姆斯·布莱克的理论属实，该组织将立即知道红队的行动。更何况，基尔已经暴露了，波旁也很快就会暴露。这将是柯南主要情节的关键逆转。
赤井家族
我们先来说说赤井武竹。十年前的涟漪篇，引发了十七年前的羽田浩二事件。正是在羽田案中，赤井武竹“遭遇了强敌”。由于情况严重，他将妻子和孩子送往“更安全”的日本，然后失踪。首先，赤井武竹失踪了，并没有像领导认为的那样死了。他可能还活着并参与了朗姆酒分会。那么这个组织在各个国家都有权力。赤井武吾为什么认为日本安全？如果赤井武竹本人打算去日本与他们会面的话，那也是有道理的。迄今为止登场的主要角色中，他们的外貌都发生了巨大的变化。昏迷十年的黑田或许就是赤井武竹的化身。情况可能是这样的：十七年前，赤井家族与羽田家族关系很好。一直在调查朗姆的赤井元竹自然也卷入了羽田案，之后又伪装成黑田进入日本警察系统。
因为是分包，“以前的一些事情我都忘记了”。他一方面继续调查羽田案，寻找统一战线的合作者，另一方面保护家人。另一方面，柯南总共两次提到“福尔摩斯的弟子”，第一次是在涟漪篇，第二次是在主角姐姐的家乡英国。或许玛丽关注了柯南，得知了他的真实身份以及他也是一名吸毒者的事实，于是世拉转学到了另一所学校，开始寻求合作。
我们来谈谈他的妻子塞拉·玛丽。所知道的是，她在十年之内就恢复了初中时的样子。这意味着她服用的药物是APTX-4869，很可能不是小艾制造的。第一个服用这种药物的人是工藤新一，可以推测缩小的时间将在一年之内。从她想要找出制作药物的人来看，她并没有主动去测试药物的效果。所以可以推测，她最近和组织发生了冲突。 “域外姐姐”是英文的“域姐”。 Territory可以缩写为“ter”，从“sister”中去掉“ter”就得到“SIS”，即英国军情六处。因此有人猜测她是军情六处特工。但不管怎样，她推理能力高超，武功高强，警惕性很高，所以她绝对会是关键人物。
青山曾在采访中指出，“作品中两个像母亲一样的角色实际上是姐妹……总之，很多角色和事件都是相互关联的。”这条因青山先生的多嘴而暴露出来的明显线索，直接指向了世罗玛丽和宫野艾琳娜。有一次在商场，最好的证据就是化了妆的小艾和变小了的女主角几乎一模一样。
目前主要剧情的分析就到此为止。接下来主线剧情的发展就是朗姆的三个选择、战黑的理论、红茶理论的猜测是否正确。
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